农学实验中心创始于 1948 年成立的东北农学院农艺系教研实验室，1996 年正式更名为东北农业大学农学实验中心，2006 年迁入新农学楼，设有经济作物实验室、作物形态与分类实验室、显微数码互动实验室、作物育种与种子检验实验室、耕作与标准化实验室和应用生物技术实验室等 6 个实验室及 1 个挂藏室和 3 个实验准备室等使用面积 838.45 m2 。2007 年经黑龙江省教育厅批准为“黑龙江省省级实验教学示范中心”；同年经国家教育部批准为“国家级实验教学示范中心建设单位”组成单位之一，2012 年经国家教育部批准为“国家级实验教学示范中心”组成单位之一。农学实验中心现有本科生实验课程指导教师 21 人，100% 具有博士学位，实验室管理人员 3 人。实验中心本科实验教学以培养“立足龙江，面向全国，有创新精神和开拓能力，有现代植物生产实践技能，服务北方寒地和区域农业发展的复合应用型农业技术人才”作为实验教学的基础目标，并实施建设国家级卓越农林人才教育培养计划改革试点项目。

农学实验中心现有教学仪器设备 881 件，总计 934 万元，“十三五”年均更新本科生实验教学仪器设备 100万元。在校内建有开放式本科实验实习作物标本圃20000m2，作物育种栽培温室1 栋 400 m2。

农学实验中心每年承担本科生作物栽培学、作物育种学、种子生物学、耕作学、绿色农产品生产与检验、植物分子生物技术、种子种苗快繁和普通遗传学等 20 门实验课程，面向专业为农学、植物保护、种子科学与工程、植物科学与技术等专业，实验课开出率为 100%，年学时近 2200 学时。

农学实验中心建立了大学生科技创新中心，为本科生搭建了实验创新平台，五年来累计完成大学生科技创新项目 20项、实验中心开放项目2项，在本科生实践创新能力培养方面作用突出。实验中心实行大型仪器共享制度，通过学校大型仪器共享平台有效的提高仪器使用率，大型仪器正常运转率 100% 。

   农学实验中心“十四五”期间将继续保持在省内同类院校中处于一流水平，力争建设成为全国同类高校一流实验教学示范中心。