铅(Pb)是土壤中分布最广泛、对环境危害最大的重金属污染物之一。铅的低流动性会导致其在土壤积累并且不可被生物降解。N6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosine, m6A)修饰是mRNA最普遍的内部修饰,在mRNA代谢和基因表达的表观遗传调控中起着重要作用,并且有助于提高植物非生物胁迫的耐受性。近日,东北农业大学陈庆山教授/齐照明研究员团队在Journal of Hazardous Materials(中科院1区TOP,IF=14.224)在线发表了题为“An analysis of differentially expressed and differentially m6A-modified transcripts in soybean roots treated with lead ”的研究论文,为研究大豆根系耐铅机制提供了新的m6A修饰候选基因。
论文研究了大豆根部对重金属铅胁迫的响应m6A甲基化组,发现m6A修饰区主要富集在3' UTR区域和终止密码子附近,并且m6A甲基化与转录本丰度呈正相关。在铅胁迫下,m6A RNA甲基化峰的转录组范围增加,研究鉴定出了1144个m6A修饰峰和1094个差异表达基因。整合m6A甲基化组和转录组结果,共鉴定出16个候选基因,其转录本在铅胁迫下存在差异甲基化和差异表达。同时,研究结果表明,这些基因可能通过ROS通路、酶、转运蛋白和激素影响大豆根系对铅的吸收、转运和积累,从而来促进豆科植物对非生物胁迫的耐受性。这些发现为如何促进铅胁迫下大豆根系生长提供了新的见解。
农学院农艺与种业专业硕士张钰为论文第一作者,东北农业大学陈庆山教授/齐照明研究员为论文通讯作者,该研究获得了大豆产业体系(东北中晚熟大豆品种改良项目)和黑龙江省博士后基金等支持。